Apabila penyakit baru muncul, para saintis di seluruh dunia mengambil tindakan untuk mengetahui apa yang dapat mereka lakukan mengenainya, dengan harapan dapat mencari cara baru untuk membantu.
Penyelidik di University of Minnesota (UM) telah melakukan hal itu – dengan meneliti struktur protein 'spike' di permukaan SARS-CoV-2, pasukan berharap mereka telah menyumbang pada dasar pengembangan ubat baru.
“Secara umum, dengan mengkaji ciri struktur protein virus mana yang paling penting untuk menjalin hubungan dengan sel manusia,” jelas penyelidik bioperubatan Fang Li, “kita dapat mengembangkan ubat yang mencarinya dan menyekat aktiviti mereka.”
Pasukan ini menggunakan kristalografi sinar-X untuk membuat model tiga dimensi seperti apa protein berduri dan bagaimana ia mengikat sel manusia.
Walaupun ini tidak terdengar seperti foto coronavirus yang biasa anda lihat, ini adalah model yang sangat berguna untuk ahli biologi. Ini membolehkan mereka memvisualisasikan bagaimana mutasi kecil dalam protein membuat pelbagai lipatan dan rabung yang membolehkan zarah virus melekat pada reseptor dalam sel kita sendiri.
Para penyelidik mendapati bahawa strain coronavirus SARS-CoV-2 mempunyai beberapa mutasi yang membentuk 'sisir' yang sangat padat dalam protein lonjakan.
Rabung ini lebih padat daripada virus SARS dan mungkin salah satu sebab ketegangan baru ini begitu mahir menjangkiti manusia, menyebabkan COVID-19.
Struktur 3D menunjukkan bahawa dibandingkan dengan virus yang menyebabkan wabak SARS pada tahun 2002-2003. Coronavirus baru telah mengembangkan strategi baru untuk mengikat reseptor manusia, sehingga mengikat ketat, 'kata Lee.
“Mengikat erat pada reseptor manusia dapat membantu virus menjangkiti sel manusia dan merebak di kalangan manusia.”
Pasukan berharap simulasi baru dapat membantu penyelidik lain mengembangkan ubat atau vaksin terhadap virus tersebut.
“Hasil kerja kami dapat membantu mengembangkan antibodi monoklonal yang bertindak sebagai ubat untuk mengenali dan meneutralkan bahagian pengikat reseptor protein lonjakan,” kata Lee.
“Atau sebilangan protein duri dapat menjadi dasar vaksin.”
Tetapi kita mesti berhati-hati pada tahap ini. Penyelidikan semacam ini terus berkembang, dan walaupun modelnya menjanjikan, kajian ini hanya menggunakan serpihan kecil virus – domainnya yang mengikat – dan oleh itu, masih ada banyak maklumat yang perlu diteliti.
Kajian itu diterbitkan dalam jurnal Nature.
Sumber: Foto: (Shang et al., Nature, 2020)
